Efter Henry VIIIs død i begyndelsen af 1547 krævede den engelske fremgangsmåde, at den ti år gamle Edward VI giftede sig med den fem år gamle Mary, dronning af Skotland. Da det pro-franske parti i Skotland gjorde indsigelser, marcherede hertugen af Somerset (Edward Seymour), engelsk protektor for drengekongen, og hertugen af Northumberland (John Dudley) en hær mod Edinburgh. Den skotske hær under jarlen af Huntly (George Gordon) angreb angriberne ved Pinkie, øst for byen, men blev stoppet og derpå slået på flugt af et engelsk kavaleriangreb den 10. september 1547. Somerset besatte Edinburgh, men fulgte ikke sejren op, delvist på grund af domestisk strid i England. Byen blev opgivet tre år senere.