Efter nederlaget på sin højre flanke ved Five
Forks, Virginia, besluttede den konføderale kommandør, general Robert
E. Lee, den 1. april at evakuere både Petersburg og Richmond. Om natten
den 2-3. april begyndte den udmattede, næsten sultende hær fra det nordlige
Virginia, at trække sig tilbage vestpå under Appomattox-floden. Lee håbede
på at føre sine 30.000 mand rundt om den føderate venstre flanke for at
slutte sig til general Joseph
Johnstons hær, som faldt tilbage i North Carolina foran general William
Shermans fremrykning. Men den føderate øverstkommanderende, general
Ulysses S. Grant, som havde 125.000 mand til sin rådighed, drev sine underordnede
hårdt for at blokere Lee's flugt. General Philip
Sheridans kavalerikorps afskar jernbanen til syden den 5. april, hvilket
tvang Lee vestpå. Næste dag overmandede det føderate II korps under general
Andrew Humphreys Lee's bagtrop ved Sayler's Creek, og tog omkring 7.000 fanger,
inklusive Richard Ewell og fem andre generaler. Føderale tab var 1.180, inklusiv 166
dræbte.
Den strammende forfølgelse tvang Lee til at krydse over til
den nordlige side af Appomattox ved Farmville den 7. april. Han fortsatte
retræten vestpå den følgende dag, forfulgt af Humpreys VI Korps under
general Horatio
Wright. På det tidspunkt havde Sheridan, med general Charles
Griffin's V korps og general Edward
Ords James-hær hastet forbi Lee's sydlige flanke for at indtage
en spærrende position ved Appomattox Station. Tidligt den 9. april prøvede
den konføderale division under general John
Gordon (1.600 infanterister) at bryde igennem for at åbne vejen til
Lynchburg. Det sidste angreb fra hæren fra det nordlige Virginia blev
slået tilbage. Kl. 16:00 samme dag overgav den omringede Lee sit sværd
og hær til den sejrrige Grant ved Appomattox Court House, nogle få kilometer
mod nordvest. Grants energiske forfølgelse står som en af de mest succesfulde
operationer af sin slags i historien. I North Carolina overgav general
Joseph Johnston den sidste større konføderale hær i felten den 18. april.
Vest for Mississippi-floden overgav general Edmund
Kirby-Smith sig den 26. maj. Den fire år lange krig var endelig overstået.