Efter at have befriet Chile, forberedte José de San Martín en ekspedition til Peru, det spanske styre i den nye verdens højborg. Invasionshæren blev ført nordpå i Thomas Cochranes (kaldet Lord Cochrane) skibe, en tidligere admiral. Efter at være gået i land ved Callao i 1820, marcherede San Martín til Lima, efter at begge byer var blevet evakueret af den spanske vicekonge José de La Serna. Den 28. juli 1821 blev Perus uafhængighed bekendtgjort. Simón Bolívar og hans dygtige general Antonio de Sucre ankom i 1822. San Martín overgav den patriotiske ledelse til Bolívar. Derefter blev krigen flyttet til royalisterne i højlandet. Den 6. august 1824 nåede Bolívar og Sucre Junin, 153 km nordøst for Lima. Her slog republikanerne afgørende La Sernas spanske hær, som blev kommanderet af general José Canterac. Sucre rykkede videre frem efter royalisterne.